A Cseh Testvérek Egyháza és annak diakóniai szolgálata is hosszú idő óta figyelemmel kíséri az Európába érkező menekültek helyzetét, s elsődleges fontosságúnak tartja, hogy a segítse a nehéz helyzetben lévőket. 2015 júliusának elején a Zsinati Tanács tagjai határozatukban is egyértelműen elutasították a menekültekkel szembeni félelem- és gyűlöletkeltést.